В качестве наиболее вероятной версии аварии «Фобос-Грунта» называется ошибка в программировании бортового вычислительного комплекса станции. Об этом, как пишет «Коммерсантъ«, говорится в докладе о причинах аварии, который накануне был представлен руководителю Роскосмоса Владимиру Поповкину. По сведениям «Коммерсанта», основной причиной инцидента называется «программный сбой, вызвавший одновременный перезапуск двух работающих каналов бортового вычислительного комплекса». Комиссия рассматривала несколько версий аварии, многие из них были признаны несостоятельными сразу, а некоторые — после стендовых испытаний. В числе последних — версия о том, что запуск «Фобос-Грунта» сорвали радары на американском полигоне имени Рейгана. В ходе испытаний электроника, аналогичная той, которая была установлена на аппарате, выдержала максимальный уровень облучения, что позволило экспертам отказаться от версий о внешнем воздействии на «Фобос-Грунт».
